Durante una spedizione archeologica sull'isola di Bardos, il Dr. Hell e il Dr. Kabuto fanno una scoperta sensazionale e riportano alla luce lo spaventoso esercito di mostri meccanici dell'antica civiltà micenea. Il Dr. Hell decide di sfruttare la scoperta per la conquista del mondo, ma il Dr. Kabuto, scampato al malvagio collega, progetta e costruisce, con l'indistruttibile Lega Z di propria invenzione, il grande robot da combattimento Mazinger Z. Scoperto il nascondiglio dello scienziato giapponese, il Dr. Hell invia i suoi soldati, le Maschere di Ferro, a ucciderlo. Ma poco prima di esalare l'ultimo respiro, Kabuto fa in tempo ad affidare a suo nipote Koji, giunto in suo soccorso, il potente robot con cui dovrà opporsi all'esercito di Hell. Al suo fianco ci saranno il Dr. Yumi del Centro di Ricerche per l'Energia Fotoatomica e la figlia di questi, Sayaka, che combatterà a bordo di Afrodite A.