Spyro, un drago viola, Stealth Elf, un'elfa abile ninja ed Eruptor, un essere formato di roccia e lava, sono tre nuovi studenti dell'Accademia degli Skylander. Sono allievi del saggio Padron Eon il protettore del Cuore di Luce e ben presto si rendono conto che il mondo delle Skylands è irto di terribili pericoli tra cui lo stregone Kaos e Malefor che vogliono far precipitare il loro mondo nell'oscurità.
