Basata sul celebre franchise videoludico, questa serie televisiva è ambientata sul pianeta Mobius, dove regna la regina Aleena. Tuttavia il suo regno è destabilizzato dal crudele Dottor Robotnik che riesce a impadronirsi del potere grazie al suo esercito di robot meccanici. Fuggita in esilio la regina Aleena cerca di proteggere i suoi tre figli, Sonic, Manic e Sonia, e assieme a loro, come previsto dalla profezia, cercherà di riprendersi ciò che è suo di diritto.