La serie segue le gesta di un gruppo di sopravvissuti, composto da soldati, scienziati e civili, che fronteggia avventure straordinarie. Dopo un attacco alla base segreta, il team di esploratori tramite uno stargate si ritrova su un'astronave, la Destiny, lanciata milioni di anni prima dagli Antichi. La rotta dell'astronave è bloccata e sconosciuta ed il gruppo è impossibilitato a tornare sulla terra. Il nuovo equipaggio deve affrontare da subito problemi concreti e basilari, come l'approvvigionamento di acqua, cibo e aria. Il gruppo sopravvissuto all'attacco ha perso tutto, tranne la speranza, ed in ogni episodio andrà incontro a nuovi mondi, antichi misteri e avventure straordinarie.
